Я рекомендую сразу подавать в ЯК. Пока сайт новый, у него не накопилось факторов, к которым Яша может придраться при размещении. Прежде чем подавать на регистрацию, обязательно добавьте реквизиты на странице контактов (если это сайт компании). Без этого, ЯК все равно не пример, это обязательное условие. После размещение в ЯК реквизиты можете убрать. Я уже давно покупаю ссылки только для новых проектов, первый год (постепенное аккуратное наращивание). Далее закупку останавливаю и наоборот снимаю потихоньку ссылки (в течение полугода), так как по большинству тематик без ссылочного можно выйти в ТОП10 совершенно спокойно. Многие со мной не согласятся)) Но это факт, проверенный мною на большом количестве проектов в разных регионах. Решать конечно Вам...