Использование Моделей данных в WP

[RORC]

которые любят переопределить поведение или добавлять логику

Те кто начинал с друпал не испугаются , хукнем уже их код .

Wordpress отлично подходит для старта проекта на готовом шаблоне или продаже плагинов под него. Любая работа по доведению до проекта выше среднего, если это не новостной сайт не оправдана, для этого есть взрослые фреймворки, та же сифония например.

как увижу хлам еще на стороне фронтенда

Зависит от плагинов и способа вставки, внутри может быть достаточно хорошо сделано. Если для джумлы это показатель, то тут нужно просить список плагинов.